Обычно подобная ошибка возникает когда не настроен ДСЧ.
#csptest -oid info
#cpconfig -hardware rndm -view

После того как последовал инструкции ftp://cryptopro.ru/pub/M...%F1%F2%E8.%20FreeBSD.pdf
и установил пакеты в следующей последовательности:
CPRObase CPROrdr CPROcpl CPROkc2 CPROcspd CPROdrv CPROdrvd CPROstnl

Получаю:
$ /opt/cprocsp/bin/ia32/cryptcp -creatrqst -provtype 75 -ex -cont "\\\\.\\HDIMAGE\\tlsserver" -dn "CN=test.ru, C=RU" -certusage "1.3.6.1.5.5.7.3.1" /tmp/server-gost.csr
CryptCP 3.33 (c) "Крипто-Про", 2002-2010.
Утилита командной строки для защиты данных.
-creatrqst - Создание запроса сертификата и сохранение его в файле PKCS #10.
Ошибка: Набор ключей РЅРµ существует (0x80090016)
[ErrorCode: 0x80090016]

$ /opt/cprocsp/bin/ia32/csptest -oid info
An error occurred in running the program.
/dailybuilds/mybuild/CSP/samples/csptest/tmain.c:1105:Can not get CSP param: AcquireContext failed.
Error number 0x2741 (10049).
Требуемый адрес для своего контекста неверен.
An error occurred in running the program.
/dailybuilds/mybuild/CSP/samples/csptest/oid.c:216:Error during CryptAcquireContext.
Error number 0x2741 (10049).
Требуемый адрес для своего контекста неверен.
Program is terminating.
[ErrorCode: 0x00002741]

$ /opt/cprocsp/sbin/ia32/cpconfig -hardware rndm -view
Nick name: CPSD
Connect name:
Rndm name: ���
Rndm level: 3

Не знаю, важно это или нет, но при установке пакетов КриптоПро получал следующие сообщения:
Installing CPRObase...
Do not forget to check and edit if needed the following files:
//var/opt/cprocsp/users/global.ini
vfs.usermount: 1 -> 1
chmod: /dev/fd0: No such file or directory
Installing CPROrdr...
pkg_add: package CPRObase-3.6.1_0 has no origin recorded
Do not forget to check and edit if needed the following files:
//etc/opt/cprocsp/config.ini
Installing CPROcpl...
pkg_add: package CPRObase-3.6.1_0 has no origin recorded
pkg_add: package CPROrdr-3.6.1_0 has no origin recorded
Installing CPROkc2...
pkg_add: package CPRObase-3.6.1_0 has no origin recorded
pkg_add: package CPROcpl-3.6.1_0 has no origin recorded
pkg_add: package CPROrdr-3.6.1_0 has no origin recorded
Shutting down cryptsrvps: empty file: Invalid argument
. Already.
...

Спасибо! После установки KC1 вместо KC2 все проблемы разрешились.
Btw. меня смутили рекомендации ставить KC2 в документации к Trusted Java.
Btw2. было не просто найти документацию по установке КриптоПро на FreeBsd (директория MacOs на ftp), лучше, если бы ссылка не неё была на странице для загрузки КриптоПро.

точно такая же ошибка но только на линуксе:
$ cryptcp -creatrqst -dn 'CN=Ivanov E=Ivanov_I@mail.ru' -cont '\\.\HDIMAGE\ivanov' /tmp/zap/rqst
CryptCP 3.33 (c) "Crypto-Pro", 2002-2010.
Command prompt Utility for data protection.
-creatrqst - Creates certificate request and saves it into PKCS #10 file.
Error: An internal error occurred. (0x80090020)
[ErrorCode: 0x80090020]


$ csptest -oid info
CSP (Type:71) v3.6.5359 KC1 Release Ver:3.6.6497 OS:Linux CPU:IA32 FastCode:READY,ENABLED.
CSP (Type:75) v3.6.5359 KC1 Release Ver:3.6.6497 OS:Linux CPU:IA32 FastCode:READY,ENABLED.
CryptAcquireContext succeeded.HCRYPTPROV: 146246763
Total:
[ErrorCode: 0x00000000]

$ /opt/cprocsp/sbin/ia32/cpconfig -hardware rndm -view

Nick name: CPSD
Connect name:
Rndm name: ▒▒▒▒
Rndm level: 3

Куда копать???

/opt/cprocsp/sbin/ia32/cpconfig -hardware rndm -add bio_tui -level 5 -name "ConsoleBioRNG"
Adding new rndm:
Nick name: bio_tui
Name device: ConsoleBioRNG
Level: 5
Failed, code:0x1008
Error code:4104, Connection error.