function InitializeHashedData(hashAlg, sHashValue) {
        // Создаем объект CAdESCOM.HashedData
        var oHashedData = cadesplugin.CreateObject("CAdESCOM.HashedData");
        // Инициализируем объект заранее вычисленным хэш-значением
        // Алгоритм хэширования нужно указать до того, как будет передано хэш-значение
        oHashedData.Algorithm = hashAlg;		
		//console.log(sHashValue);
		//oHashedData.DataEncoding = CADESCOM_BASE64_TO_BINARY;
		//oHashedData.Hash(dataToSign); // dataToSign - это строка base64
        oHashedData.SetHashValue(sHashValue);

        return oHashedData;
    }

    function CreateSignature(oCertificate, oHashedData) {

        // Создаем объект CAdESCOM.CPSigner
        var oSigner = cadesplugin.CreateObject("CAdESCOM.CPSigner");
        oSigner.Certificate = oCertificate;
        // Создаем объект CAdESCOM.CadesSignedData
        var oSignedData = cadesplugin.CreateObject("CAdESCOM.CadesSignedData");
        var sSignedMessage = "";
        // Вычисляем значение подписи
        try {
            sSignedMessage = oSignedData.SignHash(oHashedData, oSigner, CADESCOM_CADES_BES);
        } catch (err) {
            alert("Failed to create signature. Error: " + cadesplugin.getLastError(err));
            return;
        }
        return sSignedMessage;
    }

//sHashValue - параметр в функции, хеш получается на этапе загрузки и проверялся вручную для загружаемых файлов. Т.е. пока исключаю возможность некорректно сформированного хеша.
var hashAlg = CADESCOM_HASH_ALGORITHM_CP_GOST_3411; // ГОСТ Р 34.11-94
// Создаем объект CAdESCOM.HashedData
var oHashedData = InitializeHashedData(hashAlg, sHashValue);	
var sSignedMessage = CreateSignature(Certificate, oHashedData);