УЦ - это организация. Это согласно 1-ФЗ "Об ЭЦП" и 63-ФЗ "Об ЭП".
Орган криптозащиты - это часть организации. Это согласно 152 приказа ФАПСИ.
Поэтому формально орган криптозащиты в УЦ :-) Но фактически, обывательски, мы называем УЦ ту часть организации, которая обеспечивает деятельность организации в качестве УЦ. И будут ли сотрудники органа криптозащиты и сотрудники УЦ являться одними и теми же сотрудниками - определяется решением самой организации. И нет никаких нормативных документов, которые могут повлиять на решение организации по этому вопросу.

Зря так думаете, что "УЦ=органу криптографической защиты". Обычно орган криптозащиты - это 3 человека, которых обучают по 72 часа и подают в качестве выполнения лицензионного требования при получении лицензий ФСБ. А реально УЦ это больше людей. Зачем системного администратора заталкивать в орган криптозащиты? Или операторов УЦ, которые имеют самые низшие требования (на уровне делопроизводителя), запихивать в орган? Всё таки операторы УЦ самые низкооплачиваемые сотрудники УЦ и, как правило, у них высокая текучка.
Обычно руководителя УЦ и администратора специального ПО УЦ (его ещё называют администратором УЦ) обучают так, что бы можно было включить в орган криптозащиты. В этом случае помимо указанных Вами пунктов 152 приказа ФАПСИ ещё руководствуются "Положениями о лицензировании..." из 957 Постановления Правительства в части квалификационных требований.

А что Вы понимаете под "Руководитель организации "?
Если Руководитель организации - это единоличный исполнительный орган юридического лица (например, генеральный директор), то он может не иметь специального образования т.к. он может не быть руководителем УЦ и может не входить в орган криптозащиты.
Если Руководитель организации - это руководитель УЦ, то он может не иметь специального образования, т.к. он может не входить в орган криптозащиты. Но это формально! А если заместитель руководителя УЦ уйдёт в отпуск? Тогда необученный руководитель УЦ как лох будет хлопать глазами, если нужно будет оперативно решить проблему?

Конечно вправе! Я в своём посте привёл перечень функциональных ролей. Т.к. количество сотрудником меньше или равно этому количеству ролей.
Исполнение функциональных обязанностей по ролям может быть возложено на одного и более сотрудника.

Минимально допустимая численность - 1 человек, что сопадает с достижением кандидатов в книгу Гиннеса в этой номинации :-)

Если вам это важно, то если говорить о лицензировании СКЗИ, то лицензиату необходимо иметь квалифицированный персонал как минимум в количестве двух человек.