ТЗ обсуждается. Я не профи. Даю описание задачи, как сам понимаю.

Проект sky-file.ru/
В целом всё работает, надо чуток добавить функционала:
1. Возможность входа на сайт без логина/пароля, а по электронному ключу e-token
2. Автоматическая загрузка на сайт открытого ключа шифрования при регистрации.
3. Автоматическое расшифровывание при скачивании зашифрованных файлов.

Вот сайт с таким функционалом declarant.mos.ru/mosdecl/...
Используемые плагины для браузеров:
Microsoft CAPICOM plug-in
КриптоПро ЭЦП Browser plug-in