Стоит задача в подписании файлов в браузере на стороне клиента. В качестве браузеров могут выступать любые, а не только IE. Java-апплету допускается использование сторонних библиотек через JNI. В какую сторону копать информацию? поиск по форуму ничего вразумительного не дал.