На удостоверяющем центре может быть настроено автоматическое принятие запросов(что практикуется редко) либо ручная обработка. Ручная обработка, как правило, заключается в том, что оператор на стороне удостоверяющего центра просматривает Ваш запрос на сертификат и, если всё в порядке, принимает его. То есть, время когда запрос будет принят зависит не от Вас и не от того, какое на Вашем компьютере установлено ПО.
Кроме того, многим организациям для принятия запроса на сертификат требуются некоторые организационные меры, такие как отправка письма с подтверждением. По поводу этих мер можно уточнить у той организации, которая занимается Вашим обслуживанием на удостоверяющем центре.