Вот работает! Криптопро 3.6, PKI client 5.1 sp1, ОС OSuse 10.2, AltLinux 4.1.1
./cpconfig –hardware media -view
./certmgr –list –cont ‘\\.AKS ifdh 00 00\testAlt’
./certmgr –inst –cont ‘\\.\AKS ifdh 00 00\testAlt’
./csptestf –sfsign –sign –my testAlt –in test –out /home/testik/test.sign
./cryptcp –signf –dir /home/testik/test.sign –dn “testAlt” /opt/cprocsp/bin/ia32/test
./csptestf –keycopy –src ‘\\.\AKS ifdh 00 00\testAlt\’ –dest ‘\\.\hdimage\HtestAlt’
./cryptcp –creatcert –dn “cn=ettk” –both –cont ‘\\.\AKS ifdh 00 00\ettk’ –ku –certusage “1.3.6.1.5.5.7.3.4,1.3.6.1.5.5.7.3.2” –ca http://www.cryptopro.ru/certsrv
./cryptcp –encr –dn “cn=ettk” –uMy –der test test.msg (ettk контейнер на eToken)
./cryptcp –decr –dn “cn=ettk” –start test.msg test.txt(ettk контейнер на eToken)

В ближайшее время ожидается полноценная сборка для 3.6