Добрый день.
Могу вкратце пояснить источник проблемы: при первом обращении к карте провайдер получает по какой-то причине ошибку. В связи с этим считает, что нужной карты (контейнера) нет и пытается попросить у пользователя через окно выбрать (вставить) нужный носитель. В процессе показа окна считыватели непрерывно опрашиваются на предмет изменений. В какой-то момент от карты получен утвердительный ответ насчет наличия контейнера, поэтому окно и гаснет, так как в нем более нет необходимости.
Чтобы этого не происходило, нужно понять, почему карточка в первый раз не ответила провайдеру. Лично я склоняюсь к тому, что нужно смотреть в сторону PKI Client. У нас было достаточно много неожиданных проблем на машинах, где он был установлен, и которые решались удалением данной утилиты.

Также такой вопрос: а если не переходить по "приглашению" на экран интерактивных служб, а подождать 5-10 секунд, оно само не исчезнет?

А без eToken PKI Client я не вижу контейнеров.
Видеозапись.
https://cloud.mail.ru/public/6XjN/49mvpYPm2

Видеозапись
https://cloud.mail.ru/public/n8CH/NwdREzLs4

Попробовал выполнить "Program Files/Crypto Pro/CSP/csptest.exe -card -enum -v". Токен не виден.
Дальше установил SAC 8.2. Показал информацию о eToken.
Попробовал снова отозвать и выпустить сертификат - все также просит нажать на окно.

Также проверяли на ruToken у Заказчика - та же самая ситуация, но у меня ruToken нет. Перепроверить не могу.

И еще КриптоПро КС2

Отредактировано пользователем 15 апреля 2016 г. 13:24:47(UTC)  | Причина: Не указана

Попробуем воспроизвести у себя проблему.
Пришлите, пожалуйста, вывод команды "Program Files/Crypto Pro/CSP/csptest.exe -card -enum -v", когда токен виден. Это позволит идентифицировать его среди десятка разных видов еТокенов.

Видеозапись
https://cloud.mail.ru/public/FvXM/SxMLdAxSY
UAC отключил.
4.0 без Etoken PKI Client в оснаске CSP контейнеры не видит.
Установил Etoken PKI Client 5.1.
4.0 в оснаске CSP контейнеры видит, при отзыве сертификата контейнер не видит.