В справке по DSS для подписей типа CAdES описана возможность создания подписи по значению хеша, правда возможный алгоритм хеширования описан только один ГОСТ 34.11-94.

Можно ли использовать 34.11-2012? Если да, то как при этом передать идентификатор использованного алгоритма?

Ссылка не очень подробная (очень не подробная :D). Могу только предположить, что для указания алгоритма по которому уже был получен хеш, нужно передать его в запросе к конечной точке documents через тип DocumentHash? Но из справки не очевидно, что будет делать в этом случае метод documents - хешировать или подписывать?