Насколько я понимаю, здесь: "Пытаюсь добавить, на дискете находит сертификат, нажимаю далее и вот где надо выбрать контейнер пусто.. " Вы описываете процесс установки нового сертификата путём нажатия на кнопку "Установить личный сертификат".
Каким образом и откуда Вы получили сертификат, который устанавливаете? Создавали ли Вы ключи при формировании запроса на этот сертификат?
Если да, то тот ли носитель(дискета) вставлен?
Видите ли Вы на дискете папку с ключами? (при просмотре содержимого дискеты средствами windows)